MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 111444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009633	TCA	2	6	248272	248277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388058
5502	NC_009633	GTG	2	6	248329	248334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388058
5503	NC_009633	AT	3	6	248421	248426	50 %	50 %	0 %	0 %	150388058
5504	NC_009633	TGA	2	6	248462	248467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388058
5505	NC_009633	A	6	6	248505	248510	100 %	0 %	0 %	0 %	150388058
5506	NC_009633	A	7	7	248534	248540	100 %	0 %	0 %	0 %	150388058
5507	NC_009633	TACA	2	8	248604	248611	50 %	25 %	0 %	25 %	150388058
5508	NC_009633	TGG	2	6	248639	248644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388058
5509	NC_009633	AAC	2	6	248757	248762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388058
5510	NC_009633	GATT	2	8	248766	248773	25 %	50 %	25 %	0 %	150388058
5511	NC_009633	TCT	2	6	248814	248819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_009633	AATAC	2	10	248823	248832	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5513	NC_009633	TAA	3	9	248881	248889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388059
5514	NC_009633	T	6	6	248892	248897	0 %	100 %	0 %	0 %	150388059
5515	NC_009633	AGCA	2	8	248903	248910	50 %	0 %	25 %	25 %	150388059
5516	NC_009633	GCA	2	6	248943	248948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388059
5517	NC_009633	T	7	7	248978	248984	0 %	100 %	0 %	0 %	150388059
5518	NC_009633	CTT	2	6	249017	249022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150388059
5519	NC_009633	AAG	2	6	249076	249081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388059
5520	NC_009633	AAG	2	6	249095	249100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388059
5521	NC_009633	TAA	2	6	249107	249112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388059
5522	NC_009633	TTA	2	6	249114	249119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388059
5523	NC_009633	T	7	7	249140	249146	0 %	100 %	0 %	0 %	150388059
5524	NC_009633	TTG	2	6	249154	249159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150388059
5525	NC_009633	ATTA	2	8	249176	249183	50 %	50 %	0 %	0 %	150388059
5526	NC_009633	TAT	2	6	249232	249237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388059
5527	NC_009633	T	6	6	249264	249269	0 %	100 %	0 %	0 %	150388059
5528	NC_009633	TA	3	6	249360	249365	50 %	50 %	0 %	0 %	150388059
5529	NC_009633	TTC	2	6	249366	249371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150388059
5530	NC_009633	A	8	8	249521	249528	100 %	0 %	0 %	0 %	150388059
5531	NC_009633	TTG	2	6	249586	249591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150388059
5532	NC_009633	CTGTT	2	10	249697	249706	0 %	60 %	20 %	20 %	150388059
5533	NC_009633	AAT	2	6	249735	249740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388059
5534	NC_009633	TAA	2	6	249790	249795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388059
5535	NC_009633	GAT	2	6	249815	249820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388059
5536	NC_009633	T	6	6	249907	249912	0 %	100 %	0 %	0 %	150388059
5537	NC_009633	TAT	2	6	249963	249968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388059
5538	NC_009633	TAT	2	6	250117	250122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388059
5539	NC_009633	ACA	2	6	250170	250175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388059
5540	NC_009633	TACAT	2	10	250217	250226	40 %	40 %	0 %	20 %	150388059
5541	NC_009633	TGAT	2	8	250267	250274	25 %	50 %	25 %	0 %	150388059
5542	NC_009633	ATTT	2	8	250329	250336	25 %	75 %	0 %	0 %	150388059
5543	NC_009633	TTA	2	6	250363	250368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388059
5544	NC_009633	AGAA	2	8	250392	250399	75 %	0 %	25 %	0 %	150388059
5545	NC_009633	A	7	7	250398	250404	100 %	0 %	0 %	0 %	150388059
5546	NC_009633	T	7	7	250424	250430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_009633	CTA	2	6	250480	250485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_009633	ATTT	2	8	250530	250537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_009633	G	8	8	250594	250601	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_009633	AAG	2	6	250669	250674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388060
5551	NC_009633	TGA	2	6	250705	250710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388060
5552	NC_009633	GT	3	6	250726	250731	0 %	50 %	50 %	0 %	150388060
5553	NC_009633	GTG	2	6	250749	250754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388060
5554	NC_009633	ATCA	2	8	250817	250824	50 %	25 %	0 %	25 %	150388060
5555	NC_009633	T	6	6	250826	250831	0 %	100 %	0 %	0 %	150388060
5556	NC_009633	AAT	2	6	250924	250929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388060
5557	NC_009633	TA	3	6	250934	250939	50 %	50 %	0 %	0 %	150388060
5558	NC_009633	CAA	2	6	250948	250953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388060
5559	NC_009633	CAA	2	6	251013	251018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388060
5560	NC_009633	AGA	2	6	251026	251031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388060
5561	NC_009633	ATA	2	6	251035	251040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388060
5562	NC_009633	TTGAG	2	10	251066	251075	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_009633	AGTTA	2	10	251214	251223	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_009633	GTG	2	6	251277	251282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_009633	TAAAA	2	10	251330	251339	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_009633	AGG	2	6	251342	251347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_009633	GAA	2	6	251361	251366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388061
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5569	NC_009633	TA	3	6	251429	251434	50 %	50 %	0 %	0 %	150388061
5570	NC_009633	A	6	6	251441	251446	100 %	0 %	0 %	0 %	150388061
5571	NC_009633	CTG	2	6	251462	251467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388061
5572	NC_009633	TAG	2	6	251472	251477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388061
5573	NC_009633	AATA	2	8	251597	251604	75 %	25 %	0 %	0 %	150388061
5574	NC_009633	AGTA	2	8	251606	251613	50 %	25 %	25 %	0 %	150388061
5575	NC_009633	TG	3	6	251742	251747	0 %	50 %	50 %	0 %	150388061
5576	NC_009633	AGAA	2	8	251789	251796	75 %	0 %	25 %	0 %	150388061
5577	NC_009633	AGAC	2	8	251848	251855	50 %	0 %	25 %	25 %	150388061
5578	NC_009633	AAG	2	6	251856	251861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388061
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5580	NC_009633	GTA	2	6	251910	251915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388061
5581	NC_009633	GAC	2	6	251953	251958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388061
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5583	NC_009633	A	7	7	252049	252055	100 %	0 %	0 %	0 %	150388061
5584	NC_009633	AAGAAA	2	12	252061	252072	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150388061
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5587	NC_009633	GA	3	6	252130	252135	50 %	0 %	50 %	0 %	150388061
5588	NC_009633	TA	3	6	252171	252176	50 %	50 %	0 %	0 %	150388061
5589	NC_009633	GTAA	2	8	252186	252193	50 %	25 %	25 %	0 %	150388061
5590	NC_009633	GA	3	6	252211	252216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_009633	A	6	6	252225	252230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_009633	ATT	2	6	252234	252239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_009633	GAAT	2	8	252278	252285	50 %	25 %	25 %	0 %	150388062
5594	NC_009633	A	6	6	252294	252299	100 %	0 %	0 %	0 %	150388062
5595	NC_009633	TAC	2	6	252329	252334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388062
5596	NC_009633	TAA	2	6	252335	252340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388062
5597	NC_009633	ATA	2	6	252422	252427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388062
5598	NC_009633	AAG	2	6	252434	252439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388062
5599	NC_009633	AG	3	6	252502	252507	50 %	0 %	50 %	0 %	150388062
5600	NC_009633	CAT	2	6	252537	252542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388062
5601	NC_009633	ATA	2	6	252626	252631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388062
5602	NC_009633	GGA	2	6	252664	252669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150388062
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5604	NC_009633	GGT	2	6	252787	252792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388062
5605	NC_009633	TGG	2	6	252825	252830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388062
5606	NC_009633	CAA	2	6	252868	252873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388062
5607	NC_009633	AAC	3	9	252929	252937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388062
5608	NC_009633	AGAT	2	8	253043	253050	50 %	25 %	25 %	0 %	150388062
5609	NC_009633	GAG	2	6	253118	253123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150388062
5610	NC_009633	TAT	2	6	253147	253152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388062
5611	NC_009633	TGA	2	6	253161	253166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388062
5612	NC_009633	GAAA	2	8	253176	253183	75 %	0 %	25 %	0 %	150388062
5613	NC_009633	T	6	6	253184	253189	0 %	100 %	0 %	0 %	150388062
5614	NC_009633	ATG	2	6	253211	253216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_009633	C	7	7	253217	253223	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5616	NC_009633	A	6	6	253248	253253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_009633	ATCC	2	8	253257	253264	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5618	NC_009633	ATTG	2	8	253385	253392	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_009633	AAG	2	6	253423	253428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_009633	GTG	2	6	253434	253439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_009633	GT	3	6	253548	253553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_009633	GCT	2	6	253557	253562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_009633	GAC	2	6	253569	253574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_009633	AGAA	2	8	253619	253626	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_009633	AT	5	10	253659	253668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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